Protein Function Prediction for Omics Era - 9789400799646

Adnotacja funkcji genu jest głównym zagadnieniem biologii molekularnej. Znaczenie przewidywania funkcji obliczeniowych rośnie, ponieważ coraz więcej danych biologicznych na dużą skalę, w tym sekwencji genomu, struktur białkowych, danych dotyczących interakcji białko-białko, danych dotyczących ekspresji mikromacierzy i danych ze spektrometrii mas, oczekuje na interpretację biologiczną. Tradycyjnie podczas sekwencjonowania genomu adnotację funkcji genów wykonuje się metodami wyszukiwania homologii, takimi jak BLAST lub FASTA. Ponieważ jednak metody te zostały opracowane przed erą genomiki, konwencjonalne ich zastosowanie niekoniecznie jest najbardziej odpowiednie do analizy danych na dużą skalę. Dlatego też obserwujemy rosnący rozwój metod obliczeniowego przewidywania funkcji genów, nastawionych na analizę danych wielkoskalowych, a także tych, które wykorzystują dane omiczne jako dodatkowe źródło przewidywania funkcji. W tej książce omawiamy tę wyłaniającą się ekscytującą dziedzinę. Autorzy zostali wybrani spośród: 1) twórców nowatorskich metod czysto obliczeniowych, 2) twórców metod przewidywania funkcji wykorzystujących dane omikowe, 3) utrzymujących i aktualizujących bazę danych opisów funkcji poszczególnych organizmów modelowych (E. coli), które są często przywoływane