Protein Function Prediction for Omics Era - 9789400799646

Gēnu funkciju anotācija ir bijis galvenais jautājums molekulārajā bioloģijā. Skaitļošanas funkciju prognozēšanas nozīme pieaug, jo arvien vairāk liela mēroga bioloģisko datu, tostarp genoma sekvences, proteīnu struktūras, proteīna-olbaltumvielu mijiedarbības dati, mikroarray ekspresijas dati un masas spektrometrijas dati, gaida bioloģisko interpretāciju. Tradicionāli, kad genoms tiek sekvencēts, gēnu funkciju anotācija tiek veikta ar homoloģijas meklēšanas metodēm, piemēram, BLAST vai FASTA. Tomēr, tā kā šīs metodes ir izstrādātas pirms genomikas laikmeta, to parastā izmantošana ne vienmēr ir vispiemērotākā liela mēroga datu analīzei. Tāpēc mēs novērojam skaitļošanas gēnu funkciju prognozēšanas metožu attīstību, kas paredzētas liela mēroga datu analīzei, kā arī to, kas izmanto šādus omikas datus kā papildu funkciju prognozēšanas avotu. Šajā grāmatā mēs apskatām šo jauno aizraujošo jomu. Autori ir atlasīti no 1) tiem, kas izstrādā jaunas, tīri skaitļošanas metodes, 2) tiem, kas izstrādā funkciju prognozēšanas metodes, kas izmanto omikas datus, 3) tiem, kas uztur un atjaunina konkrētu modeļu organismu (E. coli) funkciju anotācijas datu bāzi, kas tiek bieži norādīti