Protein Function Prediction for Omics Era - 9789400799646

Genų funkcijos anotacija buvo pagrindinis molekulinės biologijos klausimas. Skaičiavimo funkcijų numatymo svarba didėja, nes vis daugiau didelio masto biologinių duomenų, įskaitant genomo sekas, baltymų struktūras, baltymų ir baltymų sąveikos duomenis, mikrogardelių ekspresijos duomenis ir masės spektrometrijos duomenis, laukia biologinio aiškinimo. Tradiciškai, kai sekvenuojamas genomas, genų funkcijų anotacija atliekama homologijos paieškos metodais, tokiais kaip BLAST arba FASTA. Tačiau kadangi šie metodai buvo sukurti prieš genomikos erą, įprastinis jų naudojimas nebūtinai yra tinkamiausias didelio masto duomenų analizei. Todėl stebime besivystančią kompiuterinių genų funkcijų prognozavimo metodų, skirtų didelio masto duomenų analizei, raidą, taip pat tų, kurie naudoja tokius omikos duomenis kaip papildomą funkcijų prognozavimo šaltinį. Šioje knygoje apžvelgiame šią besiformuojančią įdomią sritį. Autoriai buvo atrinkti iš 1) tų, kurie kuria naujus grynai skaičiavimo metodus, 2) tų, kurie kuria funkcijų numatymo metodus, kuriuose naudojami omikos duomenys, 3) tų, kurie prižiūri ir atnaujina konkrečių modelių organizmų (E. coli) funkcijų anotacijų duomenų bazę. dažnai nurodomi