Protein Function Prediction for Omics Era - 9789400799646

Geenifunktsiooni annotatsioon on olnud molekulaarbioloogia keskne küsimus. Arvutusfunktsioonide prognoosimise tähtsus kasvab, kuna üha enam suuremahulisi bioloogilisi andmeid, sealhulgas genoomijärjestused, valgustruktuurid, valgu-valgu interaktsiooni andmed, mikrokiibi ekspressiooniandmed ja massispektromeetria andmed, ootavad bioloogilist tõlgendust. Traditsiooniliselt tehakse genoomi järjestamisel geenide funktsiooni annotatsioon homoloogiaotsingu meetoditega, nagu BLAST või FASTA. Kuna need meetodid töötati välja enne genoomika ajastut, ei ole nende tavapärane kasutamine aga tingimata kõige sobivam suuremahuliste andmete analüüsimiseks. Seetõttu jälgime arvutuslike geenifunktsioonide ennustamismeetodite arenemist, mis on suunatud suuremahuliste andmete analüüsimiseks, ja ka neid, mis kasutavad selliseid oomikaandmeid funktsioonide prognoosimise täiendava allikana. Selles raamatus anname ülevaate sellest tärkavast põnevast valdkonnast. Autorid on valitud 1) uudsete puhtarvutusmeetodite väljatöötajate hulgast 2) omika andmeid kasutavate funktsioonide ennustamise meetodite väljatöötajate hulgast 3) konkreetsete mudelorganismide (E. coli) funktsioonide annotatsiooni andmebaasi haldajate ja uuendajate hulgast. on sageli viidatud