Genome-Wide Association Studies and Genomic Prediction - 9781627034463

Izmantojot detalizēto genoma informāciju, kas tagad kļūst pieejama, mums ir daudz datu, kas ļauj pētniekiem risināt jautājumus dažādās jomās. Genoma mēroga asociācijas pētījumi (GWAS) ir kļuvuši par būtisku pieeju, lai identificētu kandidātreģionus, kas saistīti ar sarežģītām slimībām cilvēku medicīnā, ražošanas iezīmēm lauksaimniecībā un savvaļas populāciju atšķirībām. Genomiskā prognozēšana iet soli tālāk, mēģinot prognozēt šo pazīmju fenotipiskās variācijas no genoma informācijas. Genoma mēroga asociācijas pētījumi un genoma prognozēšana apkopo ekspertu ieguldījumu, lai risinātu šo svarīgo pētījumu jomu. Sējums sākas ar sadaļu, kas aptver interesējošos fenotipus, kā arī GWAS dizaina jautājumus, pēc tam pāriet, lai apspriestu efektīvas skaitļošanas metodes lielu datu kopu glabāšanai un apstrādei, kvalitātes kontroles pasākumus, fāzēm, haplotipa secinājumus un imputāciju. Nākamajās nodaļās aplūkotas statistiskās pieejas datu analīzei, kur eksperimenta mērķis ir vai nu apstiprināt bioloģiju, identificējot ar pazīmi saistītos genoma reģionus, vai izmantot datus, lai veiktu genoma prognozes par nākotnes fenotipisko iznākumu (piemēram, paredzēt slimības sākšanos). Kā daļu no sērijas Metodes molekulārajā bioloģijā nodaļās ir sniegti noderīgi padomi par ieviešanu reālajā pasaulē.