Hands on Data Science for Biologists Using Python - 9780367546793

Pythonit kasutavate bioloogide praktiline andmeteadus on loodud tänapäeva bioloogide tohutute andmetöötlusvajaduste rahuldamiseks. Suure läbilaskevõimega tehnoloogiate tulekuga ja sellest tulenevalt omikaandmete kättesaadavusega on bioloogiateadus muutunud andmemahukaks valdkonnaks. See praktiline õpik on kirjutatud algselt andmeanalüüsi hõlbustamiseks, pakkudes Pythoni programmeerimiskeeles interaktiivset probleemipõhist õpetlikku lähenemist. Raamat algab Pythoni sissejuhatusega ja süveneb pidevalt andmete töötlemise, eeltöötluse ja visualiseerimise täpsetesse tehnikatesse. Raamatu lõpetab masinõppe algoritmid ja nende rakendused bioloogiliste andmete teaduses. Igal teemal on mõistete intuitiivne selgitus ja sellele on lisatud bioloogilisi näiteid. Selle raamatu omadused: Raamat sisaldab Pythoni abil andmeanalüüsi standardmalle, mis sobivad nii algajatele kui ka edasijõudnutele. See raamat näitab andmetöötluse ja masinõppe algoritmide toimivaid rakendusi, kasutades reaalseid bioloogilisi andmekogumeid ja probleeme, nagu geeniekspressiooni analüüs, haiguste prognoosimine, kujutise tuvastamine, SNP seos fenotüüpide ja haigustega. Arvestades visualiseerimise olulisust andmete tõlgendamisel, eriti bioloogilistes süsteemides, on andmete visualiseerimise ja joonistamise hõlbustamiseks eraldi peatükk. Iga peatükk on loodud interaktiivseks ja sellega on kaasas Jupyteri sülearvuti, et julgustada lugejaid oma kohalikes süsteemides harjutama. Raamatu teine avangardne komponent on masinõppeprojekti kaasamine, kus vanusega seotud häiretega seotud geenide tuvastamiseks kasutatakse erinevaid masinõppe algoritme. Andmeanalüüsi etappide süstemaatiline mõistmine on alati olnud bioloogiliste uuringute oluline element. See raamat on hõlpsasti juurdepääsetav ressurss, mida saab kasutada andmeanalüüsi käsiraamatuna, aga ka standardsete koodimallide taldrikuna ehitusmudelite jaoks.