Hands on Data Science for Biologists Using Python - 9780367546793

Praktiska datu zinātne biologiem, kas izmanto Python, ir konceptualizēta, lai apmierinātu mūsdienu biologu masveida datu apstrādes vajadzības. Līdz ar augstas caurlaidspējas tehnoloģiju parādīšanos un līdz ar to omikas datu pieejamību bioloģijas zinātne ir kļuvusi par datu ietilpīgu jomu. Šī praktiskā mācību grāmata tika uzrakstīta, sākot ar datu analīzes atvieglošanu, nodrošinot interaktīvu, uz problēmām balstītu mācību pieeju Python programmēšanas valodā. Grāmata sākas ar ievadu Python un nepārtraukti iedziļinās datu apstrādes, pirmapstrādes un vizualizācijas skrupulozās tehnikās. Grāmata noslēdzas ar mašīnmācīšanās algoritmiem un to pielietojumu bioloģisko datu zinātnē. Katrai tēmai ir intuitīvs jēdzienu skaidrojums un bioloģiskie piemēri. Šīs grāmatas iezīmes: Grāmatā ir iekļautas standarta veidnes datu analīzei, izmantojot Python, piemērotas gan iesācējiem, gan pieredzējušiem studentiem. Šajā grāmatā ir parādītas datu apstrādes un mašīnmācīšanās algoritmu darba ieviešanas, izmantojot reālās dzīves bioloģiskās datu kopas un problēmas, piemēram, gēnu ekspresijas analīzi, slimību prognozēšanu, attēlu atpazīšanu, SNP saistību ar fenotipiem un slimībām. Ņemot vērā vizualizācijas nozīmi datu interpretācijā, jo īpaši bioloģiskajās sistēmās, ir īpaša nodaļa datu vizualizācijas un diagrammu veidošanas vienkāršībai. Katra nodaļa ir veidota tā, lai tā būtu interaktīva, un tai pievienota Jupyter piezīmju grāmatiņa, lai mudinātu lasītājus praktizēt savās vietējās sistēmās. Vēl viena grāmatas avangarda sastāvdaļa ir mašīnmācīšanās projekta iekļaušana, kurā tiek izmantoti dažādi mašīnmācīšanās algoritmi, lai identificētu gēnus, kas saistīti ar ar vecumu saistītiem traucējumiem. Sistemātiska datu analīzes posmu izpratne vienmēr ir bijusi svarīgs bioloģisko pētījumu elements. Šī grāmata ir viegli pieejams resurss, ko var izmantot kā rokasgrāmatu datu analīzei, kā arī kā standarta kodu veidņu paplāti ēku modeļiem.