Introduction to Bioinformatics - 9781588292414

Wprowadzenie do bioinformatyki: podejście teoretyczne i praktyczne zostało napisane jako tekst wprowadzający dla studentów, absolwentów i specjalistów. Tekst ten zapewnia naukowcom zarówno ramy biologiczne umożliwiające zrozumienie pytań, przed którymi stają naukowcy zajmujący się naukami przyrodniczymi w kontekście zagadnień obliczeniowych, jak i narzędzi dostępnych obecnie do badań naukowych. Zapewnia także naukowcom zajmującym się naukami przyrodniczymi zasoby do różnych narzędzi obliczeniowych, które są dostępne we wszystkich poparte podstawowymi podstawami matematycznymi. Książka podzielona jest na cztery główne działy. Pierwsze dwie sekcje zawierają przegląd różnych procesów biologicznych rządzących organizmem i mających wpływ na zdrowie. Pierwsza część, Biochemia, biologia komórkowa i molekularna, opisuje podstawową strukturę komórkową i dekodowanie genomu. Druga część, Genetyka molekularna, obejmuje regulację genomów i molekularne podstawy genetyczne chorób będących konsekwencją replikacji genetycznej. Dokonano także przeglądu genetyki klinicznej człowieka i różnych klinicznych baz danych. Trzecia część, System operacyjny Unix, wyjaśnia system Unix używany na całym świecie do obsługi zaawansowanych narzędzi obliczeniowych. Oprócz informacji na temat instalacji i zarządzania narzędziami programowymi opartymi na systemie Unix, zaprezentowano przykłady analiz sekwencji wiersza poleceń, które umożliwią prowadzenie badań w środowisku wiersza poleceń równie wygodnym, jak w środowisku graficznego interfejsu użytkownika. Ostatnia sekcja, Aplikacje komputerowe, zawiera informacje na temat zarządzania projektami sekwencjonowania DNA i ich analizy, wraz z przeglądem, w jaki sposób można modelować DNA jako serię statystycznych wzorców. Następnie omówiono różne bazy danych genomów, reprezentację genomów i metody ich analiz na dużą skalę. Wizualizacja białek i profilowanie transkrypcji, w tym wykorzystanie oprogramowania analitycznego do biologii systemów, uzupełniają zakres prac. Tom zawiera także dodatkową płytę CD-ROM z pełnym zestawem kolorowych ilustracji z każdego rozdziału, które okażą się nieocenione dla profesorów przygotowujących kolejny kurs lub seminarium z bioinformatyki. Zawiera także ograniczone wersje próbne programów omawianych w tekście i obejmuje szerokie spektrum, od zarządzania projektami sekwencjonowania DNA po analizę mikromacierzy, oferując czytelnikowi w ten sposób możliwość łatwego dostępu do narzędzi omówionych w tekście.